Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zfp62-203ENSMUST00000109198 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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