Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Dsg1bQ7TSF1 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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