Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pramef8Q8CE24 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pramef8Q8CE24 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pramef8Q8CE24 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pramef8Q8CE24 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pramef8Q8CE24 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms