Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc187Q8C5V8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc187Q8C5V8 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms