Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Sft2d1Q5SSN7 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms