Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms