Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmod1P49813 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmod1P49813 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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