Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms