Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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