Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm20394-201ENSMUST00000173304 942 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zeb2-215ENSMUST00000200844 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tars-201ENSMUST00000022849 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AC102847.1-201ENSMUST00000228390 2498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Trim36-201ENSMUST00000037011 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 4930526F13Rik-201ENSMUST00000144718 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms