Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms