Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Igkv3-11-201ENSMUST00000197500 385 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm18129-201ENSMUST00000208834 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rpl19-ps11-201ENSMUST00000122422 591 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp54Q8BL06 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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