Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms