Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms