Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Defa1P11477 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nrip3-202ENSMUST00000041460 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms