Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21976J3QNN2 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21976J3QNN2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms