Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpusd2Q149F1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Rpusd2Q149F1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpusd2Q149F1 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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