Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Taz-213ENSMUST00000135504 747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pdzk1ip1-201ENSMUST00000030488 1119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms