Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm12146-201ENSMUST00000127604 518 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Snhg17-208ENSMUST00000154242 346 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ang-202ENSMUST00000171688 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fcer2a-207ENSMUST00000208492 1053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 9230112J17Rik-202ENSMUST00000217430 764 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr323-203ENSMUST00000214132 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm12726-201ENSMUST00000121621 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm14573-201ENSMUST00000150544 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Kank3-204ENSMUST00000173789 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Zfp87-203ENSMUST00000181573 382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Sat2-201ENSMUST00000092969 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm23985-201ENSMUST00000157140 124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm44331-201ENSMUST00000203217 388 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm11199-201ENSMUST00000118691 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm11431-201ENSMUST00000155046 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Ggta1-209ENSMUST00000164889 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Slc35a4-205ENSMUST00000185899 312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Il18-204ENSMUST00000214117 860 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 4930448C13Rik-205ENSMUST00000221781 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd1P40201 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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