Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScaperF8VQ70 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScaperF8VQ70 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms