Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Atg16l1Q8C0J2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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