Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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