Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ackr4-203ENSMUST00000188000 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Aldh8a1-201ENSMUST00000042699 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gpr61-201ENSMUST00000062028 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Aoc1-204ENSMUST00000167529 2734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Uhrf1-203ENSMUST00000113038 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cwc25-201ENSMUST00000018685 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Lrrc55-202ENSMUST00000111601 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm44168-201ENSMUST00000204835 3539 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Wfikkn2-201ENSMUST00000061469 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Krtap16-1-201ENSMUST00000105050 1888 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm11489-201ENSMUST00000118342 499 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Uspl1-206ENSMUST00000122160 3827 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Itgb2l-201ENSMUST00000000161 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Adtrp-201ENSMUST00000072012 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Btg4-201ENSMUST00000114431 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sbk3-202ENSMUST00000144863 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms