Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms