Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nccrp1G3X9C2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms