Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 1700109K24Rik-202ENSMUST00000227532 1030 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Rsph14-203ENSMUST00000159994 1728 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ccl19-201ENSMUST00000102957 745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mir6378-201ENSMUST00000183357 107 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms