Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms