Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gtpbp6Q3U6U5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms