Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q3U6N9 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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