Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CartptP56388 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CartptP56388 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CartptP56388 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms