Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Tmod1P49813 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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