Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ggta1P23336 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Ggta1P23336 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ggta1P23336 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Ggta1P23336 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Ggta1P23336 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ggta1P23336 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ggta1P23336 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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