Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cald1-204ENSMUST00000115026 4080 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm8005F6YKY3 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Btnl5-ps-201ENSMUST00000097346 1751 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Adal-202ENSMUST00000066155 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm8005F6YKY3 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms