Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 CT572998.1-201ENSMUST00000219636 1557 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Col5a3Q9JLI2 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b6-202ENSMUST00000219183 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Col5a3Q9JLI2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm29388-201ENSMUST00000190718 284 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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