Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms