Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Cntrl-202ENSMUST00000028237 7615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms