Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms