Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm9060-201ENSMUST00000120926 805 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms