Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms