Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb42P49222 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb42P49222 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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