Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer3W4VSP1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer3W4VSP1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms