Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm3550W4VSN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3550W4VSN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms