Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vstm4T1NXB5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms