Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt16Q9Z2K1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt16Q9Z2K1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms