Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lgr5Q9Z1P4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lgr5Q9Z1P4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms