Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ddx39bQ9Z1N5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx39bQ9Z1N5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms