Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf394Q9Z1D9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms