Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NgfrQ9Z0W1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms