Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb6Q9Z0T9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb6Q9Z0T9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms