Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip2Q9Z0H8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip2Q9Z0H8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms